反滲透純水機在生產純水的時候，主要依據兩個關鍵部分，一是半透膜，二是一定的壓力。簡單的說來，在反滲透膜上有很多微小的孔，這些微孔的孔徑的和水分子大小差不多，因為大部分的細菌、顆粒物、微生物、有機物等的粒徑都會比水分子要大，因此很難通過反滲透膜，因而通過反滲透膜的只有水分子。反滲透純水機正是利用這種原理來制備純水。

　　反滲透系統的基本單元是反滲透膜堆，堆膜進行組合形成反滲透系統；可將反滲透膜堆的串聯線路、分級排污；或用雙通道及組合設計法來強化系統的控制性能。目前常用的組合方式為一級多段式和兩級反滲透裝置，反滲透純水機采用多段式主要是為了提高水的回收率；采用兩級反滲透則是為了進一步提高脫鹽率，得到更高的透過水水質。反滲透系統可以單獨使用，也可以與離子交換系統、電脫鹽系統結合起來使用，以提高純水系統的總體處理能力，改善反滲透純水機的產水質量。

　　一般說來，在眾多雜質中，溶解性鹽類是難去除的。因此，反滲透純水機制備的純水是否足夠純凈，通常都是依據脫鹽率的高低來確定的，而反滲透除鹽率的高低主要決定于反滲透半透膜的選擇性，目前，較高選擇性的和泰的反滲透純水機的除鹽率高于98%，符合大部分純水項目對水質的需求。